「人文社會科學研究中心」是中央研究院在人文社會科學領域唯一的研究中心,其設立之目的是希望從事單一學門的研究所無法進行的跨領域研究。 本研究中心目前包含五個專題中心,分別為「政治思想研究專題中心」、「制度與行為研究專題中心」、「亞太區域研究專題中心」、「調查研究專題中心」,以及「地理資訊科學研究專題中心」。每一個專題中心設一位執行長,統籌研究相關事宜。 本研究中心之特色,乃是跨領域研究。例如「制度與行為研究專題中心」以經濟學方法為基礎,結合法律、資訊及地理等專業,共同探討網路經濟、實證法學及空間競爭等跨領域議題;「亞太區域研究專題中心」的研究計畫涵蓋了跨界與流動、海洋史、發展與人口等領域;「政治思想研究專題中心」則結合政治、歷史、法學、哲學等相關領域,從事比較政治思想之研究。